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Ce que l'on voit au microscope · Fluorescence

Ce que l'on voit avec un microscope à fluorescence

Une couche de cellules endothéliales marquée par trois colorants fluorescents, comme la préparation commerciale FluoCells n° 1 : DAPI dans les noyaux, phalloïdine couplée à l'Alexa Fluor 488 sur l'actine et MitoTracker Red CMXRos dans les mitochondries. Chaque colorant absorbe une couleur de lumière et en émet une autre, de longueur d'onde plus grande.

Changez de filtre dans le panneau : UV, bleu ou vert.

100× : la couche de cellules

Les cellules endothéliales forment une couche de cellules plates, les unes à côté des autres, comme un pavage. Avec le filtre bleu, on voit leur squelette d'actine.

400× : un filtre, un colorant

Sous lumière UV de 365 nm, les noyaux brillent en bleu (DAPI). Sous lumière bleue de 485 nm, l'actine brille en vert (phalloïdine). Sous lumière verte de 525 nm, les mitochondries brillent en rouge (MitoTracker). Le filtre d'émission laisse passer la lumière émise par le colorant et bloque celle qui l'éclaire.

1000× : filaments et mitochondries

Avec l'objectif à immersion, on distingue les filaments d'actine et les mitochondries une à une. Si l'on laisse la lumière allumée, la fluorescence s'éteint peu à peu : c'est le photoblanchiment.

Une cellule, de près

Le noyau, le squelette d'actine et les mitochondries, chacun avec son colorant. Au microscope, on les voit séparément, un avec chaque filtre.

Vue en 3D : au microscope, on la voit à plat, depuis le dessus.

Quel microscope à fluorescence vous faut-il ?

Il faut une source de lumière d'excitation et un jeu de filtres pour chaque colorant. Ceux qui indiquent la fluorescence dans leur fiche ont des LED UV, bleue et verte avec leurs filtres.

De quel microscope ai-je besoin ?

Questions fréquentes

Comment fonctionne un microscope à fluorescence ?

Il éclaire l'échantillon avec une lumière d'une couleur qui excite le colorant ; le colorant émet une lumière d'une autre couleur, de longueur d'onde plus grande, et un filtre ne laisse passer que cette lumière vers l'oculaire.

Que colore le DAPI ?

L'ADN : c'est pourquoi il marque les noyaux. Sous excitation UV, il émet dans le bleu.

Pourquoi la fluorescence s'éteint-elle ?

À cause du photoblanchiment : la lumière d'excitation dégrade peu à peu le colorant. Il vaut donc mieux n'éclairer que le nécessaire.

Comment cette simulation est construite

Ce n'est pas une photographie : c'est un modèle calculé. Les grossissements, le champ et la résolution proviennent de la fiche technique de chaque microscope ; les dimensions de l'échantillon, des sources citées ci-dessous.

QuoiComment c'est calculéCe qui est approximatif
Grossissement et champGrossissement = oculaire × objectif. Champ = indice de champ de l'oculaire ÷ grossissement de l'objectif.Exact selon la fiche.
Colorants et spectresDAPI 358/461 nm, phalloïdine Alexa Fluor 488 505/512 nm, MitoTracker Red CMXRos 579/599 nm (excitation/émission, fiche de Thermo Fisher).Couleurs d'écran approximatives.
FiltresCeux de la fiche de l'Achios-X AX.3152-PLi : EX 330-385/EM 420 LP, EX 460-495/EM 510 LP et EX 510-550/EM 575 LP. Chaque filtre allume un seul colorant.Le fait qu'avec un filtre on ne voie rien des autres colorants n'est pas vérifié : les filtres d'émission sont des passe-haut.
MesuresCellule d'environ 600 µm² et noyau d'environ 140 µm² (cellules endothéliales d'aorte).Il n'existe pas de mesure publiée pour les cellules BPAE ; la forme des fibres et des mitochondries est choisie. Fibres et mitochondries dessinées plus épaisses pour être visibles à l'écran.
PhotoblanchimentLa fluorescence s'éteint peu à peu tant que la lumière est allumée.Le rythme est choisi.

Sources

Autres échantillons

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